ساخت الیگو نوکلئوتید (پرایمر، پروب و …)

• تحویل سریع:

  تعهد ما برای تحویل الیگوهای عادی ۳-۲ هفته از زمان ارسال ایمیل و تأئید سفارش است. اما در عمل، متوسط زمان تحویل گاه بسیار کوتاه تر از مدت گفته شده است. (با توجه به شرایط کنونی زمان تحویل تغییر نموده است لطفا برای اطلاع با ما تماس بگیرید.)

• تضمین OD !

برای کلیه الیگوهای عادی کوتاه تر از ۳۰ نوکلئوتید که به روش Bio-RP تخلیص شده اند، میزان OD تحویلی تضمین می شود!

* تضمین OD برای الیگوهای بلندتر از ۳۰ نوکلئوتید یا الیگوهای دارای تغییرات شیمیایی یا تخلیص شده به روش های HPLC/PAGE وجود ندارد. لطفاً جهت اطلاع از OD و مقدار تحویلی این نوع الیگو ها به “جدول بازده نهایی” مراجعه کنید تا بتوانید با توجه به مقدار مورد نیازتان، مقیاس ساخت (Scale) صحیح را انتخاب کنید.

• کیفیت عالی.

تمامی الیگوهای سنتز شده بصورت پیش فرض به روش BioRP خالص سازی می شوند و این بسیار کارآمدتر از روشهای نمک زدایی (de-salting) صرف است.

امکان تخلیص الیگوها به روش های HPLC و PAGE نیز وجود دارد. (در مورد تغییرات شیمیایی فلؤورسانس تخلیص به روش HPLC الزامی است.)

• کنترل کیفی Maldi-Tof برای هر الیگو .

  تمامی الیگوهای سنتز شده توسط طیف سنج جرمی (Maldi-Tof) کنترل کیفی می شوند. در برخی موارد از PAGE برای کنترل کیفی استفاده می شود.
  در هرصورت به همراه هر الیگو برگه ای دریافت خواهید کرد که علاوه بر سایر اطلاعات، تصویر و اطلاعات آزمون کنترل کیفیت انجام شده نیز در آن درج شده است.

• قیمت کم نظیر!

همانند دیگر محصولات و خدمات مان، لیست قیمت ما همیشه روی سایت و در اختیار مشتریان است. لطفا سری به آن بزنید و اگر سؤالی داشتید با ما تماس بگیرید.

۱٫ فرم سفارش ساخت الیگو نوکلئوتید را از روی سایت (صفحه دانلود/فرمهای ضروری) بردارید.

۲٫ برای هر پرایمر نام اختصاصی انتخاب نمایید.

۳٫ در ستون Sequences، فقط و فقط توالی الیگونوکلئوتید مورد نظرتان را از چپ به راست بنویسید و از نوشتن ‘۵ , ‘۳، فاصله (space)، تغییرات شیمیایی و … خودداری کنید.

۴٫ مقیاس سنتز (scale) را برای هر الیگو نوکلئوتید انتخاب کرده و فقط عدد مربوط به OD را مقابل توالی الیگو نوکلئوتید ثبت نمایید.

۵٫ تخلیص پرایمرها با روش BioRP انجام می شود(بدون هزینه), در صورت تمایل به استفاده از روش های دیگر گزینه خود را  از لیست مندرج در فرم انتخاب نمایید و در مقابل توالی ثبت نمایید.

۶٫ برای بازهای مخلوط (mixed bases)از این کدها استفاده نمایید:

(R(a, g); Y(c, t); M(a, c); K(g, t); S(g, c); W(a, t); V(a, c, g); H(a, t, c); B(g, t, c); D(g, a, t); N(a, c, g, t

7. تغییرات شیمیایی (modification) مورد نظر را، در صورت وجود، مقابل توالی مربوطه ثبت نمایید. (در صورتیکه تغییرات مورد نظرتان در صفحۀ ساخت الیگونوکلئوتید (پرایمر، تغییرات شیمیایی، پروب دو نشاندار) موجود نیست با ما تماس بگیرید.)

۸٫ مشخصات کامل درخواست کننده شامل: آدرس کامل و تلفن در دسترس/ همراه قید شود.

۹٫ در صورت متفاوت بودن درخواست کننده با فاکتور شونده حتماً مشخصات کامل فاکتور شونده نوشته شود که در این حالت سفارش پرایمرها تنها با تأیید فاکتور شونده صورت می گیرد.

۱۰٫ فرم تکمیل شده را بوسیله رایانامه (email) به نشانی info {at} takapouzist.com ارسال نمایید، در کمتر از یک روز کاری پاسخی به رایانامه شما داده خواهد شد. در صورتی که پاسخ/رسید را دریافت نکردید مجدداً فرم را برای ما ارسال نمایید

انواع تغییرات شیمیایی یک طرفه یا داخلی در ساخت الیگونوکلئوتیدها (Modifications)

جدول زیر حاوی برخی انواع متداول تغییرات شیمیایی است. برای مشاهده فهرست کامل و نیز استفاده از امکاناتی همچون مشاهده ساختار هر گروه شیمیایی، لطفاً پیوند زیر را دنبال کنید.

در مورد کلیه تغییرات شیمیایی فلؤورسانس در انتهای ’۵ یا ’۳، تخلیص به روش HPLC الزامی است و هزینه مربوط افزوده خواهد شد.

ساخت پروب های دونشاندار (Dual Labeled)

برای ساخت پروب های دونشاندار، گروه های شیمیایی اضافه شده به دو سر الیگو نوکلئوتید می بایست با هم سازگار باشند یعنی محدوده نشر (Emission) فلؤروفور اصلی، در بازه انگیزش (Exitation) و یا جذب عامل دوم که در اینجا خاموش کننده (quencher) نامیده می شود قرار داشته باشد. برای بررسی این سازگاری از جدول زیر استفاده کنید.

تخلیص کلیه پروب ها به روش HPLC صورت می گیرد که بهای آن در قیمت پروب نهایی لحاظ شده است یعنی هزینه اضافی بابت تخلیص HPLC دریافت نمی گردد.

به دلیل برخی مسایل فنی/تجاری، سفارش پروب های حاوی TAMRA و MGB مطابق جدول ذیل بدون انتخاب مقیاس ساخت و تنها با انتخاب مقدار تحویلی نهایی صورت می گیرد.

قیمت برخی از انواع متداول پروب ها در لیست قیمت آمده است.

لازم به ذکر است که امکان سنتز تمامی موارد در مقیاس های بالاتر نیز وجود دارد.

1. OD به چه معنی است؟

OD همان چگالی نوری یا Optical Density است که معرفی از غلظت است و بنابراین هرچه OD بالاتر باشد، مقدار پرایمر بیشتر است و برای تعداد آزمون های بیشتری قابل استفاده خواهد بود.

2. مقیاس ساخت به چه معنی است و تفاوت آن با OD چیست؟

مقیاس ساخت (Synthesis Scale)، یعنی مقیاسی که با آن واحدهای ساختمانی سازندۀ الیگو نوکلئوتیدها (نوکلئوتیدها) در واکنش وارد می شوند. با توجه به کارایی واکنش در پایان کار محصول تولید شده به همان میزان نیست و در نهایت OD است که تعیین کنندۀ مقدار به دست آمده است.

3. به نظر شما چه OD ای مناسب است؟

OD انتخابی بستگی تام و تمام به تعداد تست های PCR دارد. طبیعتاً هرچه تعداد واکنش های PCR بیشتر باشد مقدار بیشتری از پرایمر نیز مورد نیاز است.

با توجه به جدول زیر یک محاسبۀ حدودی امکان پذیر است.

۱ معمولاً برای هر واکنش PCR (در حجم ۲۰ میکرولیتر)، یک میکرولیتر پرایمر با غلظت ۲۰ پیکومولار استفاده می شود.

۲ (برای یک الیگو با طول و ترکیب بازی معمول ۳۰-۲۰ باز)

4.   زمان تحویل چند روز پس از ارسال سفارش است؟

با توجه به ارسال حداقل یک سفارش در هفته، زمان تحویل بین ۲ تا ۳ هفته از دریافت سفارش شما خواهد بود. (برای مشاهده زمان متوسط به نشانگر آن در صفحه اصلی نگاه کنید.)

۵٫ حداکثر طول قابل ساخت چند باز است؟

حداکثر طول قابل ساخت، ۱۳۰ باز است. اطلاعات کامل در جدول زیر آمده است.

۶٫ تخلیص به روش BioRp یعنی چه؟

در این روش با استفاده از کروماتوگرافی فاز معکوس (Reverse Phase) نمک ها و درصد عمده ای از الیگوهای ناقص (کوتاه سنتز شده) از محصول نهایی حذف می شوند. در صورت نیاز به خلوص بیشتر می بایستی از روش های دیگر مثل HPLC و PAGE استفاده شود.

7. فرق تخلیص به روش BioRp و نمک زدایی معمولی (desalting) چیست؟ 

در روش نمک زدایی علاوه بر اینکه بخاطر عدم حذف برخی الیگوهای ناقص سنتز شده (N-1 Failure Oligos)، خلوص و کیفیت الیگوی نهایی (که در برخی کاربردها اهمیت تعیین کننده دارد) پائین است،  وجود این ناخالصی ها سبب می شود تا هنگام خوانش و تعیین OD، با بالا بردن کاذب غلظت موجب کاهش فاحش محصول مورد نظر شوند. تصویر زیر این خطا را در طولهای متفاوت الیگوها نشان می دهد.  

8. چه مقدار آب به پرایمرم اضافه کنم؟

به همراه هر پرایمر یک برگه ی داده ها (Data Sheet) ارسال می شود که مشخصات کامل الیگو و از جمله میزان آب مورد نیاز برای تهیۀ مخزن ۱۰۰ پیکومولار آمده است.

زمان تحویل  الیگونوکلئوتید

زمان تحویل بین دو تا سه هفته از زمان دریافت E-mail شما است.
(با توجه به شرایط کنونی زمان تحویل تغییر نموده است لطفا برای اطلاع با ما تماس بگیرید.)

سفارشات به نشانی سفارش دهنده ارسال می شود.

زمان بندی ارسال سفارش ها

تنها سفارشاتی که  E-mail آنها تا ساعت ۲۴ شنبه به شرکت رسیده باشند و تا ساعت ۱۲ روز یکشنبه توسط مسؤول فروش منطقه ای* تایید شده باشد،در سفارش ارسالی آن دوره قرار خواهند گرفت.

* فردی که در واحد فروش مسؤولیت دانشگاه، مرکز، استان و … شما را به عهده دارد.